Ничего с мотором не делай. фаза выпуска отличается от фазы продувки в обе стороны. Сделав пропилв напильником/надфилем по днищу поршня в месте перепуска, можно сделать и хуже. Вообще, судя по нагарной "бабочке" на поршне, у тебя всё симметрично и хорошо.
Справочно: на некоторых моторах перепуск на треть не открывается, это нормально. Важно помнить, что холодный поток перепускаемой смеси охлаждает донышко поршня, а масло, содержащееся в смеси, ещё и смазывает.
Так что закрой мотор и отойди от мотоцикла)))))))